Le mouvement Ennahda a précisé ce 26 juin que les désaccords entre le gouvernement et la présidence ne résidaient pas dans le principe de l’extradition, mais seulement « dans les circonstances d’exécution de la décision d’extrader l’ancien Premier ministre libyen ».
 Le mouvement a ajouté son intention de protéger le rôle important et indispensable de la présidence dans l’expérience d’alliance, « important dans la réussite de la transition démocratique ».
 Concernant l’extradition de Baghdadi Mahmoudi, Ennahda estime qu’elle a eu lieu par une décision juridique indépendante et « exécutée à l’issue du conseil ministériel d’un gouvernement légal ».
 Par ailleurs, le mouvement a rappelé que le gouvernement, la présidence et des organisations humanitaires avaient envoyé une délégation commune en Libye pour s’enquérir sur place des conditions de détention et d’organisation des procès.
 La délégation avait alors reçu des garanties écrites de la part des autorités libyennes, selon Ennahda.
 Enfin, un membre du bureau politique de Ennahda, Nouredine Arbaoui, a déclaré au micro de Radio Kalima que cette décision n’aurait aucune incidence sur la troïka et démenti les risques de division en son sein.
 En réaction aux accusations de certains partis politiques affirmant que l’extradition était un accord politique entre les deux pays, Nouredine Arbaoui a démenti toutes ces accusations, les considérant comme des scénarios fabriqués par l’opposition « pour faire de l’opposition ».